Auch wenn Mäuse sehr kleine Tiere sind, müssen sie dennoch artgerecht gehalten werden, denn sie sind sehr aktiv, so dass ein gewisser Platz vorhanden sein sollte. Außerdem kann man Mäuse auch nicht frei in der Wohnung laufen lassen, so dass sie im Grunde fast ihr ganzes Leben im Käfig verbringen.
Leider gibt es im Zoofachhandel kaum passende Käfige für Mäuse, bei den meisten sind die Gitterabstände zu groß. Man muss bedenken, dass die Knochen der Maus sehr weich sind, so dass sie sich durch die engsten Ritzen quetschen kann. Der Abstand zwischen den Gitterstäben darf deshalb auf keinen Fall größer als 0,6 bis 0,8 Millimeter sein! Auch an den Käfigtüren gibt es häufig größere Spalten, hier muss man unbedingt darauf achten, dass auch hier keine Ausbruchsgefahr besteht.
Der Käfig sollte eine Mindestgröße von 80 x 50 x 50 Zentimeter haben, damit die Mäuse ausreichend Platz haben. Wesentlich sicherer ist die Haltung der Mäuse in einem Aquarium oder Terrarium, wobei es auch hier einige Punkte zu beachten gilt. Wichtig ist vor allem eine ausreichende Belüftung, deshalb darf die Höhe des Aquariums nicht größer sein als dessen Tiefe. Terrarien sind deshalb etwas besser für die Mäusehaltung geeignet, da diese über Belüftungselemente verfügen.
Auf den Behälter sollte man auf jeden Fall einen Gitterrahmen auflegen, damit die Mäuse nicht ausbrechen können. Der Vorteil einer Haltung im Glasbehälter ist auch die optimale Sicht auf die Tiere, sowie das Vermeiden von umherfliegender Einstreu. Ein Nachteil kann, neben der schlechteren Belüftung, die fehlende Möglichkeit mehrere Ebenen anzubringen sein. In diesem Fall muss man selbst ein wenig basteln, um seinen Haustieren eine abwechslungsreiche Einrichtung bieten zu können.
Zubehör aus Plastik hat in einem Mäusekäfig nichts verloren, denn die Tiere nagen sehr gerne, so dass sie eventuell gesundheitliche Schäden davontragen könnten. Man kann natürlich auch selbst eine Unterkunft für die Tiere bauen, dabei muss man jedoch auf die Verwendung ungiftiger Materialien achten, und darf den Mäusen keine Möglichkeit zum Anfressen des Holzes geben, zum Beispiel durch raue Kanten.
Wer handwerklich eher ungeschickt ist, der kann sich auch eine kleine Voliere bauen lassen, allerdings muss man hierfür etwas tiefer in die Tasche greifen. Holz muss man auf jeden Fall immer mit einem ungiftigen Lack beschichten, da ansonsten der Urin der Mäuse eindringen kann. Wichtig ist immer, dass man in der Unterkunft der Tiere eine Tränke anbringen kann, denn ein Wassernapf wäre ständig verschmutzt.